En la rizosfera se dan muy diversos fenomenos de simbiosis: por la secreción de sustancia solidas o liquidas de las raíces, las plantas proporcionan a los microorganismos muchos nutrientes necesarios para su desarrollo como proteínas, azucares, aminoácidos, ácidos orgánicos, etc; a su vez muchos microorganismos aportan a las plantar ciertos nutrientes con antibioticos, hormonas vegetales, elementos nutritivos, etc.

El los porcesos de nutricion de las plantas apartir de la interacción con microorganismos, deben destacarse tres tipos de microorganismos fundamentales: Captadores de nitrógeno, micorrizas y fotosínteticos:

Los captadores de nitrógeno (bacterias de los generos Rhizobium, Azospirillum, Azotobacter, Anabaena, entre otros) permitan la mineralización del nitrógeno que sólo puede encontrarse en la naturaleza disuelto en la atmósfera y como componente de la materia orgánica; estas bacterias son las únicas capaces de transformación el nitrógeno atmósferico y hacerlo aprovechable para los demás seres vivos.

Las micorrizas (hongos agrupados), se asocian con las raíces creciendo en el superficie o dentro del tejido radicular y cumple funciones tales como:

• Aumentar la capacidad de absorción de nutrientes por las raíces, por la capacidad de exploración del hongo.
• El hongo puede degradar los nutrientes orgánicos inaccesible para su huésped.
• El hongo minimiza las adversidades climáticas, especialmente la sequía.
• Muchas micorrizas son capaces de formar sustancias fúgicas, antibacteriana y a veces antivirales que protegen a la planta huésped contra los patógenos.

Los microorganismos fotosintéticos se encargan de la producción de altas cantidades de materia orgánica utilizable de manera directa por otros microorganismos y plantas cultivadas.

La nutrición de las plantas dependen, de lo que los microorganismos dispongan de suficiente alimento para ser dirigido y como resultado de ellos las plantas dispongan de sustancias mineralizadas y orgánicas para su alimentación; así mismo, depende de que se establezcan adecuadas relaciones de cooperación entre plantas y microorganismos que garanticen a cada una de las partes las sustancias que les permite una alimentación y nutrición óptima.